凝胶迁移实验（Electrophoretic Mobility Shift Assays， EMSA）是用于确定蛋白质是否与特定的DNA片段结合的实验。随着应用与技术的发展，现在也逐渐应用于检测蛋白质与RNA的相互作用（例如碧云天新推出的化学发光法RNA EMSA试剂盒）。

*EMSA，也称gel shift获得的结果是体外的(In Vitro)目标蛋白和预期基因组DNA或RNA片段的结合结果，可以推断细胞内也发生类似的结合。

实验原理：该实验主要基于DNA/蛋白质或RNA/蛋白质复合物在聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）中有不同迁移率的原理。如图1所示，使用生物素或同位素等标记核酸探针，蛋白质与相应的核酸结合后在聚丙酰胺凝胶电泳条件下，迁移速率低于未发生结合的核酸，产生“滞后”条带（shift band）。

图1.EMSA实验原理。

实验分组

通常情况下做EMSA实验需要包括以下分组（如图2）：
1.阴性对照：仅有标记探针，用来确定探针里是否有杂质；
2.常规反应：含激活的目的转录因子的核蛋白＋标记探针；
3.探针冷竞争反应：含激活的目的转录因子的核蛋白＋标记探针+标记探针100倍量的未标记探针，判断探针结合特异性，排除假阳性，如果未标记探针（即冷探针）可以竞争结合蛋白，表明所使用的探针是特异的；
4.突变探针的冷竞争反应：含激活的目的转录因子的核蛋白＋标记探针+标记探针100倍量的未标记突变探针；进一步验证探针特异性；
5.Super-shift反应：含激活的目的转录因子的核蛋白＋标记探针+目的转录因子的特异抗体，进一步验证探针特异性及确定与探针结合的蛋白是否是预期蛋白。

图2.一个典型的EMSA/Gel-Shift分析图。

客户案例

案例一：
2023年1月18日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所吕雪峰、朱涛等人与德国佛莱堡大学合作，在Nature Communications （IF:17.694）杂志上合作发表了题为CvkR is a MerR-type transcriptional repressor of class 2 type V-K CRISPR-associated transposase systems的研究成果，该研究鉴别了cyanobacterium Anabaena sp基因组中由一个CAST (AnCAST)系统基因编码的MerR型转录调节因子Alr3614及其同源物，为CAST系统原型工作模式的认知及基因编辑工具开发提供了新思路。
特别地，该研究所涉及的EMSA实验主要使用了碧云天化学发光法EMSA试剂盒（GS009）和BeyoECL Plus (超敏ECL化学发光试剂盒)(P0018)。

案例二：
2021年5月13日，中国农业大学刘金华及宁夏大学魏凡华共同通讯在Nature Microbiology （IF:30.964）杂志上发表题为IFI16 directly senses viral RNA and enhances RIG-I transcription and activation to restrict influenza virus infection的研究成果，该研究了证明DNA感应器IFI16增强IFN-I的产生以抑制甲型流感病毒（IAV）复制。
特别地，该研究使用碧云天EMSA探针生物素标记试剂盒（GS008）成功对目标DNA进行了标记。

产品信息：

产品编号	产品名称	包装
GS002	EMSA/Gel-Shift 试剂盒	100次
GS005	EMSA/Gel-Shift 结合缓冲液(5X)	100次
GS006	EMSA/Gel-Shift 上样缓冲液(无色, 10X)	200次
GS007	EMSA/Gel-Shift上样缓冲液(蓝色, 10X)	200次
GS008	EMSA探针生物素标记试剂盒	20次
GS009	化学发光法EMSA试剂盒	100次
GS606	化学发光法RNA EMSA试剂盒	100次
GS301S	BeyoGel™ EMSA PAGE预制胶(4%, 10孔)	10块
GS302S	BeyoGel™ EMSA PAGE预制胶(4%, 15孔)	10块
GS305S	BeyoGel™ EMSA PAGE预制胶(6%, 10孔)	10块
GS306S	BeyoGel™ EMSA PAGE预制胶(6%, 15孔)	10块