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残留DNA提取与检测全攻略

宿主DNA残留的片段可能具有免疫原性、感染性或者致瘤性,当其残留水平过高时就可能引发免疫反应、致病性感染以及诱发肿瘤等安全问题。WHO和欧盟要求每剂生物制品中残留的DNA含量不能超过10ng,而FDA甚至要求每剂不能超过100pg,我国药典也规定以细胞基质生产的生物制剂DNA残留量不能超过100pg/剂,以细菌或真菌基质生产的疫苗DNA残留量不能超过10ng/剂。可见,检测和控制宿主DNA残留非常重要!碧云天BeyoMag™磁珠法残留DNA样品制备试剂盒大肠杆菌DNA残留探针法qPCR检测试剂盒CHO DNA残留探针法qPCR检测试剂盒从提取到检测全方位助力您检测残留DNA!

BeyoMag™磁珠法残留DNA样品制备试剂盒

碧云天研发生产的BeyoMag™磁珠法残留DNA样品制备试剂盒是一种使用新型核酸纯化介质包被的磁珠,用于稳定、高效、便捷地从各种生物制品的中间品、半成品和成品中提取并纯化残留的大肠杆菌、酵母、昆虫或哺乳动物等宿主细胞微量DNA的试剂盒。本试剂盒制备的DNA样品可以用于相关DNA残留qPCR检测试剂盒。

  产品原理

本试剂盒的原理和操作流程如图1所示。样品中蛋白首先被蛋白酶K消化,释放出来的基因组DNA在特定条件下与磁珠特异性结合。在外界磁场(如磁分离架)的作用下,磁珠与相应溶液可以快速高效地分离。随后通过两次洗涤去除各种杂质,最后通过洗脱液将DNA从磁珠上洗脱下来。整个过程无需酚氯仿抽提,无需酒精沉淀,全程仅需约20分钟即可完成。

  产品效果

回收率高,有保障!使用E.coli DNA Control模拟样品的回收率测试结果见下表:

回收前残留DNA浓度 回收前体积 回收后残留DNA浓度 回收后体积 回收率
30fg/μl 100μl 32.6fg/μl 100μl 109%
3fg/μl 100μl 3.08fg/μl 100μl 103%

注1:回收率和样品浓度、体积、样品种类及实验操作等的不同而存在差异,表中数据仅供参考。
注2:根据中华人民共和国药典(2020年版‧三部)“外源性DNA残留测定法”中“第三法 定量PCR”对于结果计算的要求,加标样品的回收率应在50%~150%之间。

低水平残留DNA也无忧!本试剂盒在提取低至飞克(Femtogram, fg)水平的残留DNA时仍具有较高的回收率,通常无需添加糖原、酵母RNA或Poly A等Carrier RNA或Oligo dT等Carrier DNA。如下表,使用本试剂盒对100μl模拟待测样品(含BSA)以及对应的加标样品(即在待测样品基础上再添加一定量的标准品)进行样品制备操作,并使用碧云天大肠杆菌DNA残留探针法qPCR检测试剂盒(D7701)检测样品浓度:

重复 待测样品CT值 待测样品lgCT 待测样品浓度 加标样品CT值 加标样品lgCT 加标样品浓度 回收率
1 33.53 0.97 9.36fg/μl 31.6 1.54 35.0fg/μl 85.4%
2 34.30 0.74 5.53fg/μl 31.84 1.47 29.7fg/μl 80.5%
3 33.82 0.89 7.68fg/μl 31.73 1.51 32.0fg/μl 81.1%

大肠杆菌DNA残留探针法qPCR检测试剂盒

碧云天研发生产的大肠杆菌DNA残留探针法qPCR检测试剂盒是一种通过探针法qPCR快速、有效、高灵敏地定量检测各种生物制品样品品中E.coli宿主细胞残留基因组DNA含量的试剂盒。本产品为防污染型,含有优化比例的高品质UDG酶和dUTP,可有效消除PCR扩增过程中带来的产物污染问题造成的假阳性或CT值偏低。

  产品效果

本试剂盒能高效灵敏地检测E.coli宿主细胞的残留DNA,最低检测限可至3fg/μl:

图2.碧云天大肠杆菌DNA残留探针法qPCR检测试剂盒(D7701)用于不同浓度梯度的阳性对照的扩增曲线及标准曲线。

本试剂盒特异性强,HeLa细胞和CHO细胞基因组DNA对E.coli DNA残留检测无干扰:

图3.碧云天大肠杆菌DNA残留探针法qPCR检测试剂盒(D7701)检测不同浓度梯度阳性对照以及分别加入10倍量HeLa和CHO细胞基因组DNA的阳性对照的标准曲线。

本试剂盒稳定性高,不同程度的碎片化DNA对E.coli DNA残留检测基本无干扰:

图4.碧云天大肠杆菌DNA残留探针法qPCR检测试剂盒(D7701)对不同程度碎片化大肠杆菌DNA的检测效果图。

CHO DNA残留探针法qPCR检测试剂盒

碧云天研发生产的CHO DNA残留探针法qPCR检测试剂盒是一种通过探针法qPCR快速、有效、高灵敏、高特异性地定量检测各种生物制品样品中CHO宿主细胞残留基因组DNA含量的试剂盒。本产品为防污染型,含有优化比例的高品质UDG酶和dUTP,可有效消除PCR扩增过程中带来的产物污染问题造成的假阳性或CT值偏低。

  产品效果

本试剂盒能高效灵敏地检测CHO宿主细胞的残留DNA,最低检测限可至飞克(Femtogram, fg):

Target 300pg/μl 30pg/μl 3pg/μl 300fg/μl 30fg/μl 3fg/μl NTC
平均CT值 19.4 22.84 26.24 29.72 32.78 36.25 Undetermined
平均lgCT 2.5 1.48 0.46 -0.57 -1.48 -2.51 -
浓度 315.25pg/μl 29.86pg/μl 2.91pg/μl 268.01fg/μl 32.94fg/μl 3.06fg/μl -

图5. 碧云天CHO DNA残留探针法qPCR检测试剂盒(D7703)用于不同浓度梯度的阳性对照的扩增曲线及标准曲线。

本试剂盒特异性强,HeLa细胞和E.coli细胞基因组DNA对CHO DNA残留检测无干扰:

图6. 碧云天CHO DNA残留探针法qPCR检测试剂盒(D7703)检测不同浓度梯度阳性对照以及分别加入3ng HeLa或E.coli细胞基因组DNA的阳性对照的标准曲线。

本试剂盒稳定性高,不同程度的碎片化DNA对CHO DNA残留检测基本无干扰:

图7. 碧云天CHO DNA残留探针法qPCR检测试剂盒(D7703)对不同程度碎片化CHO DNA的检测效果图。

图8. 不同量MNase碎片化处理的CHO基因组DNA的电泳图。

  产品信息

产品编号 产品名称 包装 产品价格
D0051S BeyoMag™磁珠法残留DNA样品制备试剂盒 50次
D0051M BeyoMag™磁珠法残留DNA样品制备试剂盒 200次
D7701S 大肠杆菌DNA残留探针法qPCR检测试剂盒 50次
D7701M 大肠杆菌DNA残留探针法qPCR检测试剂盒 200次
D7703S CHO DNA残留探针法qPCR检测试剂盒 50次
D7703M CHO DNA残留探针法qPCR检测试剂盒 200次