产品编号 | 产品名称 | 产品包装 | 产品价格 |
D7103S | BeyoNGS™ DNA Library Quick-Prep Kit (For Illumina) | 20次 | 1598.00元 |
D7103M | BeyoNGS™ DNA Library Quick-Prep Kit (For Illumina) | 100次 | 6298.00元 |
碧云天生产的BeyoNGS™ DNA Library Quick-Prep Kit (For Illumina),中文名为BeyoNGS™ DNA快速建库试剂盒(Illumina平台)。本试剂盒是针对于Illumina高通量测序平台研发的一款快速建库试剂盒,采用体外转座技术,仅需10分钟即可一步实现1-100ng DNA的片段化并添加上接头,无需经过传统文库制备时的片段化、末端修复、接头连接等繁琐步骤,随后使用本试剂盒进行PCR扩增就能获得适用于Illumina测序平台的高通量测序文库。本试剂盒具有DNA样品需求量低、操作方法简便、文库构建时间短等优点,适合于基因组DNA、PCR扩增产物或质粒等样品的片段化、接头连接及扩增。
二代测序(Next generation sequencing, NGS),又称为高通量测序(High-throughput sequencing)或深度测序(Deep sequencing),是基于PCR和基因芯片发展而来的新一代DNA测序技术。二代测序的实验操作步骤包括:样品准备(Sample preparation)、成簇(Cluster generation)、测序(Sequencing)和数据分析(Data analysis)。在二代测序中单个DNA分子必须扩增成由相同DNA组成的基因簇,然后通过同步复制来增强荧光信号强度从而解读出DNA序列。但是随着读长的增加,基因簇复制的协同性降低,导致测序质量下降,因此二代测序的准确读长会受到一定的限制,目前两端测序的情况下读长通常不超过500bp或600bp [1]。
本试剂盒的工作原理及流程步骤如图1所示。基因组DNA等DNA样品在BeyoNGS™ Tn5 Transposome的作用下通过Tagmentation (including DNA fragmentation and tagging)一步反应实现DNA片段化(Fragmentation)和接头连接,连接产物通过后续的PCR反应进行缺口填补,并借助双端标识PCR引物(Dual-Indexed PCR Primers)扩增后,制备成适用于Illumina二代测序平台的DNA文库,再经过DNA分选磁珠等方法去除大片段DNA、引物和PCR反应液等,最终得到片段大小符合预期的DNA文库用于二代测序[2-4]。
图1. BeyoNGS™ DNA Library Quick-Prep Kit (For Illumina) (D7103)的建库流程图。PCR扩增引物须根据实验需要自行准备。PCR扩增产物的长度主要集中在300bp左右,通常在200-500bp范围内。
本试剂盒提供了更适合文库扩增的BeyoNGS™ PCR Master Mix (2X),使用了高保真、扩增速度快的DNA Polymerase,提供了优化的反应缓冲液,只需加入上一步骤获得的DNA片段与接头的连接产物及适当引物,大大简化了文库扩增操作,减少了PCR操作过程中可能导致的污染,而且扩增过程中的错误发生概率极低,确保文库扩增的保真度、高效率、均一性和可重复性。
本试剂盒不提供扩增反应所需的Dual-Indexed PCR Primers。碧云天提供的BeyoNGS™ Dual-Indexed Primers of Tagmentation Set1/2/3/4 (For Illumina) (D9021/D9022/D9023/D9024),每个系列(Set)含有48种双端8bp索引序列(barcode)的组合引物,当4个系列一起使用可构建384种不同Barcode组合文库,用户可根据实验需求适当选择使用。
产品用途:本试剂盒适用于将DNA样品制备成Illumina高通量测序平台专用文库。采用碧云天的BeyoNGS™ DNA Library Quick-Prep Kit (For Illumina)制备的DNA文库效果,请参考图2。
图2. 碧云天BeyoNGS™ DNA Library Quick-Prep Kit (For Illumina)制备的DNA文库效果图。在20μl反应体系中,加入100ng Lamda DNA及相应量的BeyoNGS™ Tn5 Transposome,55ºC孵育5min,反应完毕加入5μl Stop Buffer (5X),混匀后55ºC孵育5min终止反应。产物经相应引物分别PCR扩增5、10和15个循环,得到的产物即为适用于Illumina二代测序平台的DNA文库(未进行片段大小分选)。加入适量 DNA上样缓冲液(6X) (D0071),使用BeyoGel™琼脂糖预制胶(D0161)进行电泳检测。实际效果会因样品种类、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
本试剂盒BeyoNGS™ Tn5 Transposome中的ME和接头(Adapters)的序列如下。
ME: 5'-p-CTGTCTCTTATACACATCT-3'-OH
Primer 1: 5'-OH-TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG-3'-OH
Primer 2: 5'-OH-GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG-3'-OH
注:上述接头序列与Nextera® DNA Sample Preparation Kit (Illumina, FC-121-1030/1031)或Nextera XT DNA
Library Preparation Kit (Illumina, FC-131-1024/1096)一致。
按使用说明操作,如果每个反应使用1μl的BeyoNGS™ Tn5 Transposome (20μM),本试剂盒小包装和中包装可分别进行20次和100次反应。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7103S-1 | BeyoNGS™ Tn5 Transposome (20μM) | 20μl |
D7103S-2 | Reaction Buffer (5X) | 200μl |
D7103S-3 | Stop Buffer (5X) | 250μl |
D7103S-4 | BeyoNGS™ PCR Master Mix (2X) | 0.6ml |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7103M-1 | BeyoNGS™ Tn5 Transposome (20μM) | 100μl |
D7103M-2 | Reaction Buffer (5X) | 1ml |
D7103M-3 | Stop Buffer (5X) | 1.25ml |
D7103M-4 | BeyoNGS™ PCR Master Mix (2X) | 3ml |
— | 说明书 | 1份 |
-20ºC保存,一年有效。
注意事项:本试剂盒中的BeyoNGS™ Tn5 Transposome (20μM)储存溶液含50%甘油,在-20ºC保存不会冻结。须避免-80ºC保存,否则会冻结,反复冻融可能会影响Tn5转座酶的活性。
本试剂盒中的BeyoNGS™ Tn5 Transposome (20μM)较为粘稠,吸取时注意取样量准确,加样后请注意充分吹打混匀,避免产生气泡。
本试剂盒中的BeyoNGS™ Tn5 Transposome (20μM)的反应底物为DNA,不能用于RNA实验。
BeyoNGS™ PCR Master Mix (2X)在使用前,一定要完全融化,并上下颠倒轻轻混匀后才能使用,尽量避免产生气泡。
所需的Ultrapure Water,推荐选购碧云天的BeyoPure™ Ultrapure Water (DNase/RNase-Free, Sterile) (ST876)。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Components | Volume |
DNA Sample | xμl (1-100ng) |
Ultrapure Water | (15-x)μl |
Reaction Buffer (5X) | 4μl |
BeyoNGS™ Tn5 Transposome (20μM) | 1μl |
Step | Temperature |
1 | 55ºC, 5-10min |
2 | 10ºC, 10min |
Components | Volume |
DNA fragments with adapters | 24μl |
i5 primer (10μM) | 0.5μl |
i7 primer (10μM) | 0.5μl |
BeyoNGS™ PCR Master Mix (2X) | 25μl |
Total Volume | 50μl |
Step | Temperature | Time | Cycles |
1 | 68ºC | 3min | 1 |
2 | 92ºC | 3min | 1 |
3 | 92ºC | 30s | 4-14* |
4 | 68ºC | 90s | |
5 | 68ºC | 10min | 1 |
6 | 4ºC | - | - |
DNA Sample | Cycles | |||
1ng | 11 | 12 | 13 | 14 |
5ng | 8 | 9 | 10 | 11 |
20ng | 6 | 7 | 8 | 9 |
50ng | 4 | 5 | 6 | 7 |
PCR Products (ng) | 400 | 600 | 1000 | 1500 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
D7102 | BeyoNGS™ Tn5 Transposase | 800/4000pmol |
D7103 | BeyoNGS™ DNA Library Quick-Prep Kit (For Illumina) | 20/100次 |
D9021 | BeyoNGS™ Dual-Index Primers of Tagmentation Set1 (For Illumina) | 48种 |
D9022 | BeyoNGS™ Dual-Index Primers of Tagmentation Set2 (For Illumina) | 48种 |
D9023 | BeyoNGS™ Dual-Index Primers of Tagmentation Set3 (For Illumina) | 48种 |
D9024 | BeyoNGS™ Dual-Index Primers of Tagmentation Set4 (For Illumina) | 48种 |
D9037-Set01 | BeyoNGS™ Bidirect Amp Dual-Index Primers Set01 (For Illumina) | 96次, 24标签对 |
D9037-Set02 | BeyoNGS™ Bidirect Amp Dual-Index Primers Set02 (For Illumina) | 96次, 24标签对 |
D9037-Set03 | BeyoNGS™ Bidirect Amp Dual-Index Primers Set03 (For Illumina) | 96次, 24标签对 |
D9037-Set04 | BeyoNGS™ Bidirect Amp Dual-Index Primers Set04 (For Illumina) | 96次, 24标签对 |
D0038 | BeyoMag™ DNA长度分选磁珠 | 1/5/20/100ml |
D0039 | BeyoMag™ II DNA长度分选磁珠 | 1/5/20/100ml |